工程合同纠纷诉讼程序包括：
1、诉讼是指与案件有利害关系的当事人向认为有管辖权的提起诉讼；
2、在准备辩护和请求的实践中，被告一旦对起诉事项进行实质性辩护，就表示接受了的管辖权，今后不得以无管辖权为由进行辩护；
3、证据保全程序是对所有与案件有关的证据。如果将来有丢失、丢失或难以使用的危险，一方可以在起诉前或起诉后向提出申请，并要求采取必要措施进行保全；
4、提供诉讼证据。如果诉讼当事人想证明他在诉讼中主张的事实或要求，必须先提供证据证明，证据包括人证、物证、书证、鉴定、勘验记录等；
5、为防止被告隐匿、出售或转让财产，使原告在未来胜诉时一无所获，使判决无法强制执行，应及时申请保全程序；
6、根据选定的管辖进行案件审理，确定具体的审理和答辩；
7、作出初审判决后，裁判和上诉如有不服，可及时上诉。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百一十九条 起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民受理民事诉讼的范围和受诉人民管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百二十条 起诉应当向人民递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民记入笔录，并告知对方当事人。
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百二十一条 起诉状应当记明下列事项：
（一）原告的姓名、性别、年龄、民族、职业、工作单位、住所、联系方式，法人或者其他组织的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务、联系方式；
（二）被告的姓名、性别、工作单位、住所等信息，法人或者其他组织的名称、住所等信息；
（三）诉讼请求和所根据的事实与理由；
（四）证据和证据来源，证人姓名和住所。