法律分析：
一般来说水域滩涂养殖证应该在渔业行政主管部门办理。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》 第一条 为了加强土地管理，维护土地的社会主义公有制，保护、开发土地资源，合理利用土地，切实保护耕地，促进社会经济的可持续发展，根据，制定本法。