1、涵盖范围不同
房屋不动产权证包括土地、森林、宅基地和建筑物等的所有权。简而言之就是它们是归属于你的私人物品，你拥有它们的抵押、使用及经营等权利，及法律规定下的相关权利。房产证仅证明拥有者对该房子的使用权和共有权。房产证包含在不动产权证里面，但房产证不能和不动产权证划上等号。
2、发证机关不同
房屋不动产权证由国土资源局颁发，房产证由中华人民共和国住房和城乡建设部颁发。
3、需要缴纳的费用不同
房屋不动产权证只需要在不动产登记中心登记并缴纳一次费用就行，房产证需要对缴纳两次测绘费用，分别是土地面积和房屋面积，还需要缴纳两次制证的工本费。